实时荧光定量PCR,也称为定量PCR(QPCR),是现代分子生物学中的强大而必不可少的技术。它允许在PCR过程中放大和定量特定的DNA或RNA序列,从而可以精确测量基因表达,病原体检测和遗传分析。与传统的PCR不同,该PCR仅在反应完成后提供定性结果,实时PCR提供了对扩增过程的持续监视,从而得出定量数据。在本文中,我们将探讨什么是实时PCR,其工作原理以及其在各个领域的应用。
实时PCR系统是标准PCR机器的高级版本。它集成了荧光检测系统,以监测放大过程中PCR产物的积累。该系统提供有关正在扩增的DNA或RNA量的实时数据,可用于定性和定量分析。 实时荧光定量PCR系统被广泛用于临床诊断,遗传研究和其他各种分子应用中。
●DNA和RNA的定量: 实时荧光定量PCR 通过测量放大周期中发出的荧光来准确定量核酸。这使得甚至具有高灵敏度的少量DNA或RNA也可以。
●连续监测:与常规PCR不同,在反应完成后确定结果,实时PCR系统会在发生时监视反应。这使研究人员可以实时观察放大过程并获得精确的定量数据。
●荧光检测:实时PCR中最常用的荧光检测方法是DNA结合染料(例如SYBR绿色)和序列特异性探针(例如Taqman探针)。这些荧光分子与扩增的DNA结合时会发出光,并且荧光强度与样品中的DNA量相关。
实时PCR 的原理 类似于传统PCR的原理,但是随着较大的扭曲:通过检测荧光实时监测扩增过程。实时PCR过程中的关键步骤如下:
1。变性:加热双链DNA以分离链,形成单链模板进行扩增。
2。退火:降低温度,以使特定的引物与单链DNA上的互补序列结合。
3。延伸:调节温度以允许DNA聚合酶延伸引物,并合成新的DNA链。
4。荧光测量:在延伸阶段,荧光染料或探针与扩增的DNA结合。每个循环后测量染料或探针发出的荧光。荧光量与要扩增的DNA量成正比,可以实时监测。
在实时PCR中,绘制了每个周期中收集的荧光数据以创建放大曲线。该曲线通常显示两个不同的阶段:
●指数阶段:在此阶段,DNA的量与每个循环倍增,并且荧光呈指数增加。这是进行定量的地方,因为荧光与样品中的DNA量成正比。
●高原阶段:在一定数量的循环之后,反应到达了试剂耗尽的平台,放大速率降低了。指数阶段的数据用于准确定量。
实时PCR分析有两种主要类型:基于SYBR绿色的测定和基于探针的测定。
一个。 SYBR绿是一种DNA结合染料,与双链DNA结合时会荧光。这是一种用于检测放大DNA的简单且具有成本效益的方法。
b。当引物高度具体并且仅放大一个目标时,此方法效果很好。但是,SYBR绿色可以与任何双链DNA结合,这意味着非特异性产品可能导致结果不准确。
一个。基于探针的测定使用荧光标记的DNA探针与两个引物之间的目标序列结合。这些探针通常是塔克曼探针或类似的系统,它们在放大过程中裂解时释放荧光。
b。基于探针的测定比SYBR绿色测定法具有更大的特异性,因为它们依靠三个组件(引物和探针)与目标结合,从而减少了非特异性扩增的机会。
c。该方法是多重测定方法的理想选择,其中单个反应同时检测到多个靶标。
实时荧光定量PCR系统 已成为生物学研究和诊断领域的各个领域中必不可少的工具。一些最常见的应用程序包括:
实时荧光定量PCR广泛用于定量基因表达分析。研究人员可以使用逆转录(RT)将样品转换为互补DNA(cDNA),然后使用实时PCR来量化cDNA,从而测量样品中特定mRNA的量。该技术对于理解基因调节,研究对环境刺激的细胞反应以及分析药物或治疗对基因表达的影响很有价值。
实时荧光定量PCR是一种用于检测病原体,细菌和真菌等病原体的强大工具。它允许快速和敏感的传染剂检测,这对于临床诊断至关重要。例如,实时PCR被广泛用于检测病毒感染,例如HIV,流感和Covid-19,以及细菌感染(如结核病)。
实时荧光定量PCR在样品中提供了对DNA或RNA的精确量化。这在诸如测量临床样本中的病毒载荷,确定基因拷贝数变化以及实时监测PCR反应的进展之类的应用中特别有用。
实时荧光定量PCR也用于环境监测中,以检测水,土壤和空气中的微生物。例如,它可用于检测水传播病原体或评估食品和农产品中转基因生物(GMO)的存在。
研究人员使用实时PCR研究基因突变,多态性和基因缺失。量化特定遗传序列的能力可以检测癌症研究,遗传疾病和个性化医学中的突变。
实时荧光定量PCR提供了比传统PCR的几个优点,这使其成为许多实验室的首选选择:
●定量:实时荧光定量PCR提供定量结果,从而可以精确测量样品中的核酸。
●速度:实时荧光定量PCR消除了PEST PCR处理的需求,例如凝胶电泳,减少了获得结果所需的时间。
●灵敏度:实时荧光定量PCR甚至可以检测到少量的DNA或RNA,这是需要高灵敏度的应用。
●自动化:许多实时PCR系统都是完全自动化的,增加了吞吐量并降低了人为错误的可能性。
●降低污染风险:由于在封闭管中进行实时PCR,因此污染的风险被最小化。
实时荧光定量PCR系统彻底改变了研究人员分析DNA和RNA的方式。他们提供具有高灵敏度和精确度的实时,定量数据的能力使它们在诊断,基因表达分析,病原体检测和遗传研究等领域必不可少。无论您是研究基因调节,检测传染病还是监测环境健康,实时PCR系统都提供了无与伦比的准确性和效率。
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